Matematik ve Fen Bilimleri Eğitimi Anabilim dalının misyonu, lisansüstü programları çağın gerektirdiği yeniliklere uygun hale getirerek modern yöntemler ve teknolojik gelişimler doğrultusunda lisans üstü eğitimi sürekli dinamik tutan, bu bağlamda lisans üstü eğitimi hem yerli hem yabancı aday ve öğrenciler için cazip kılmayı önemseyen, mezun ettiği öğrencilerin hem sosyal hayatta hem piyasada hem de kamu kuruluşlarında aranan değerli elemanlar olarak yetişmeleri için gerekli tüm tedbirleri alan eğitimin değişik alanlarında aydın ve yaratıcı düşünen, bilgi toplumunun yeniliklerine hazır olan öğretmenler ve akademisyenler yetiştirmektir.